Lymská borelióza predstavuje pre zvieratá veľmi vážnu hrozbu, ktorá je žiaľ často podceňovaná aj samotnými veterinári. Ak nie je včas liečená, prechádza, rovnako ako u človeka, do ďalších fáz ochorenia so všetkými zdravotnými komplikáciami a často končí predčasným úmrtím zvieraťa.
Okrem človeka postihuje borelióza veľmi často psy, mačky a niektoré hospodárske i voľne žijúce zvieratá. K prenosu infekcie je nutné, aby kliešť bol na koži prisatý minimálne 6 až 48 hodín. Počas tejto doby dochádza k množeniu baktérií a ich prestupu do slinných žliaz kliešťa, odkiaľ sa prenášajú do organizmu zvieraťa. Po preniknutí do hostiteľa sa baktérie šíria v mieste vpichu, množia sa a prechádzajú do krvi a lymfy.
Počas niekoľkých týždňov dochádza k rozšíreniu infekcie do tkanív a kĺbov. U psov sa lymská borelióza prejavuje najčastejšie akútnym zápalom kĺbov. U postihnutých zvierat sa objavia náhle krívanie, bolestivosť a opuch jedného alebo niekoľkých kĺbov. Medzi ďalšie príznaky patrí zvýšená teplota až horúčka, apatia a nechutenstvo. K vzácnym klinickým prejavom ochorenia sa radí postihnutie srdca a obličiek a narušenie nervového systému prejavujúce sa agresivitou, kŕčmi a zmenami správania. Kožné zmeny v podobe rožširujúceho sa začervenania sa u psov vyskytujú iba veľmi zriedka.
Klinické príznaky sa u psov objavia obvykle za dva až päť mesiacov po napadnutí kliešťami. U niektorých zvierat, rovnako ako u človeka, prebieha ochorenie bez zjavných príznakov a nepozorovane prechádza do druhej a tretej fázy choroby, kedy je už ťažko liečiteľné. Komplikácie v neskorých štádiách choroby sú prevažne kĺbové a neurologické. Pokiaľ nie je borelióza liečená včas, spôsobuje chronické zápaly kĺbového aparátu, ktoré, najmä u väčších plemien, prispievajú ku kratšej životnosti zvieraťa. Aj keď je pôvodca Lymskej boreliózy citlivý k pomerne širokému spektru antibiotík, je nevyhnutné užívať liečivá po dobu troch až štyroch týždňov, čo môže byť, zvlášť u veľkých plemien psov, pomerne nákladné. Vhodnejšie je preto predchádzať ochoreniu účinnou a včasnou liečbou na základe laboratorního vyšetření. To prebieha rovnako ako u človeka. Účinné antibiotiká sú doxycyklín, penicilíny (amoxicilín a ceftriaxón) a makrolidy (azitromycín).